Paketti: snpomatic (1.0-7 ja muut)

[ Source: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Muut pakettiin snpomatic liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei ia64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi snpomatic

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.0-7	76.0 kt	217.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.0-7	83.6 kt	208.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.0-7	71.6 kt	216.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.0-7	66.4 kt	167.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.0-7	67.5 kt	127.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.0-7	76.0 kt	180.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.0-7	85.9 kt	211.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.0-5	106.7 kt	393.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.0-7	73.6 kt	183.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.0-7	74.8 kt	222.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.0-7	80.1 kt	280.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.0-7	82.2 kt	216.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.0-7	77.9 kt	156.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.0-7	79.3 kt	204.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.0-7	90.2 kt	215.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.0-7	67.5 kt	1,050.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.0-7	83.3 kt	199.0 kt	[tiedostoluettelo]