Paketti: sibsim4 (0.20-5 ja muut)

[ Source: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Muut pakettiin sibsim4 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

Imuroi sibsim4

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.20-5	30.9 kt	85.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.20-5	29.7 kt	73.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.20-5	28.1 kt	73.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.20-5	27.5 kt	72.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.20-5	26.2 kt	56.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.20-5	28.8 kt	69.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.20-5	30.8 kt	80.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.20-5	36.3 kt	112.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.20-5	25.6 kt	60.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.20-5	29.3 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.20-5	31.9 kt	150.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.20-5	31.9 kt	85.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.20-5+b1	30.7 kt	65.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.20-5	30.5 kt	77.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.20-5	29.5 kt	60.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.20-5	27.7 kt	78.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.20-5	28.5 kt	72.0 kt	[tiedostoluettelo]