Paketti: ltrsift (1.0.2-10)

[ Source: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Comparing, Data Organisation, use::viewing, x11::application

Muut pakettiin ltrsift liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D vector graphics library

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  GDK Pixbuf library

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)

  GLib library of C routines

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout and rendering of internationalized text

• rec: last-align

  genome-scale comparison of biological sequences

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Imuroi ltrsift

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	92.6 kt	468.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	96.6 kt	364.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	88.7 kt	464.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	87.6 kt	326.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	87.5 kt	278.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	91.3 kt	337.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	106.3 kt	410.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	109.0 kt	561.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	87.5 kt	334.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	83.3 kt	479.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	98.5 kt	528.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	98.0 kt	464.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	95.9 kt	316.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	90.7 kt	364.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	106.9 kt	400.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	97.8 kt	346.0 kt	[tiedostoluettelo]