Paketti: covtobed (1.3.5+dfsg-2 ja muut)

[ Source: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Muut pakettiin covtobed liittyvät paketit

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi covtobed

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.3.5+dfsg-2	45.8 kt	211.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.3.5+dfsg-2	49.8 kt	146.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.3.5+dfsg-2	44.6 kt	146.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.3.5+dfsg-2	42.8 kt	125.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.3.5+dfsg-2	44.6 kt	97.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.3.5+dfsg-2	45.5 kt	123.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.3.5+dfsg-2	53.4 kt	149.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.3.5+dfsg-2	57.1 kt	240.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.3.5+dfsg-2	47.0 kt	137.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.3.5+dfsg-2	46.4 kt	215.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.3.5+dfsg-2	49.7 kt	210.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.3.5+dfsg-2	49.7 kt	210.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.3.5+dfsg-2+b1	48.2 kt	111.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.3.5+dfsg-2	46.3 kt	138.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.3.5+dfsg-2	54.0 kt	145.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.3.5+dfsg-2	39.5 kt	1,045.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.3.5+dfsg-2	50.4 kt	133.0 kt	[tiedostoluettelo]