Paketti: clonalorigin (1.0-8)

[ Source: clonalorigin  ]

inference of homologous recombination in bacteria using whole genome sequences

Bacteria, unlike us, can reproduce on their own. They do however have mechanisms that transfer DNA between organisms, a process more formally known as recombination. The mechanisms by which recombination takes place have been studied extensively in the laboratory but much remains to be understood concerning how, when and where recombination takes place within natural populations of bacteria and how it helps them to adapt to new environments. ClonalOrigin performs a comparative analysis of the sequences of a sample of bacterial genomes in order to reconstruct the recombination events that have taken place in their ancestry.

Muut pakettiin clonalorigin liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• rec: libxml-parserl-perl

  Paketti ei saatavilla

Imuroi clonalorigin

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	179.2 kt	482.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	167.6 kt	437.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	153.2 kt	417.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	148.3 kt	400.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	143.5 kt	292.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	178.2 kt	427.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	169.3 kt	452.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	242.5 kt	822.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	163.6 kt	464.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	172.8 kt	498.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	172.1 kt	481.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	180.0 kt	481.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	188.3 kt	357.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	139.9 kt	425.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	191.8 kt	417.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	142.8 kt	1,061.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	182.2 kt	464.0 kt	[tiedostoluettelo]