Paketti: bppsuite (2.4.1-7)

[ Source: bppsuite  ]

Bio++ program suite

The Bio++ Program Suite is a package of programs using the Bio++ libraries and dedicated to Phylogenetics and Molecular Evolution. All programs are independent, but can be combined to perform rather complex analyses. These programs use the interface helper tools of the libraries, and hence share the same syntax. They also have several options in common, which may also be shared by third-party software.

The following programs are included:

 - BppML for maximum likelihood analysis,
 - BppSeqGen for sequences simulation,
 - BppAncestor for ancestral states reconstruction,
 - BppDist for distance methods,
 - BppPars for parsimony analysis,
 - BppSeqMan for file conversion and sequence manipulation,
 - BppConsense for building consensus tree and computing
   bootstrap values,
 - BppReRoot for tree rerooting.
 - BppTreeDraw for tree drawing.
 - BppAlnScore for comparing alignments and computing alignment scores.
 - BppMixedLikelihoods for computing site per site likelihoods of
   components of mixture models.
 - BppPopGen for population genetics analyses.

Muut pakettiin bppsuite liittyvät paketit

• dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Core library

• dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Phylogenetic library

• dep: libbpp-popgen8t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Population Genetics library

• dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Sequence library

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei alpha]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: bppsuite-examples

  Examples for Bio++ program suite

Imuroi bppsuite

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	372.9 kt	2,439.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	379.9 kt	2,002.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	354.2 kt	2,422.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	321.6 kt	1,606.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	328.6 kt	1,326.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	391.4 kt	2,024.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	386.4 kt	1,830.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	386.9 kt	2,965.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	367.7 kt	1,794.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	346.9 kt	2,606.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	380.2 kt	2,806.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	376.2 kt	2,614.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	363.1 kt	1,670.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	359.2 kt	1,994.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	402.9 kt	2,166.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	332.2 kt	12,453.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	377.5 kt	1,742.0 kt	[tiedostoluettelo]