Paketti: python3-htseq (2.0.5-1 ja muut)

[ Source: htseq  ]

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

This package contains the Python 3 module.

Muut pakettiin python3-htseq liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, m68k]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei x32]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 5) [x32]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ei x32]

  dep: python3 (<< 3.9) [x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ei x32]

  dep: python3 (>= 3.8~) [x32]

• dep: python3-numpy [x32]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [ei x32]

• dep: python3-numpy-abi9 [ei x32]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

Imuroi python3-htseq

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	2.0.5-1	422.9 kt	2,164.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	2.0.5-1	477.5 kt	1,837.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	2.0.5-1	415.0 kt	1,836.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	2.0.5-1	411.3 kt	1,668.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	2.0.5-1	420.4 kt	1,276.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	2.0.5-1	475.3 kt	1,914.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	2.0.5-1	401.3 kt	1,652.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	2.0.5-1	378.0 kt	2,076.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2.0.5-1	453.0 kt	2,156.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	2.0.5-1	471.9 kt	1,472.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	2.0.5-1	536.4 kt	1,622.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.11.3-1	268.1 kt	816.0 kt	[tiedostoluettelo]