Paketti: pplacer (1.1~alpha19-6)

[ Source: pplacer  ]

phylogenetic placement and downstream analysis

Pplacer places reads on a phylogenetic tree. guppy (Grand Unified Phylogenetic Placement Yanalyzer) yanalyzes them. rppr is a helpful tool for working with reference packages.

Pplacer places query sequences on a fixed reference phylogenetic tree to maximize phylogenetic likelihood or posterior probability according to a reference alignment. Pplacer is designed to be fast, to give useful information about uncertainty, and to offer advanced visualization and downstream analysis.

Muut pakettiin pplacer liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.33)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.25.0)

  SQLite 3 (jaettu kirjasto)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi pplacer

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	2,895.3 kt	18,060.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	3,452.6 kt	21,020.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	3,036.3 kt	22,769.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	3,054.6 kt	20,017.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64 (epävirallinen siirros)	2,633.1 kt	17,330.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2,712.9 kt	19,926.0 kt	[tiedostoluettelo]