Tarkennettu haku
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: libseqlib  ]

Paketti: libseqlib-dev (1.2.0+dfsg-11 ja muut)

Links for libseqlib-dev

Screenshot

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti libseqlib:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data (dev)

C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.

This package contains the header files and static library.

Tagit: Software Development: Kirjastot, Role: Development Library

Muut pakettiin libseqlib-dev liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Imuroi libseqlib-dev

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Versio Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros) 1.2.0+dfsg-11+b1 230.5 kt1,644.0 kt [tiedostoluettelo]
amd64 1.2.0+dfsg-11+b1 216.1 kt1,197.0 kt [tiedostoluettelo]
arm64 1.2.0+dfsg-11+b1 203.1 kt1,207.0 kt [tiedostoluettelo]
armel 1.2.0+dfsg-11+b1 204.1 kt1,108.0 kt [tiedostoluettelo]
armhf 1.2.0+dfsg-11+b1 205.6 kt1,005.0 kt [tiedostoluettelo]
i386 1.2.0+dfsg-11+b1 228.3 kt1,031.0 kt [tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros) 1.2.0+dfsg-11+b1 264.6 kt1,753.0 kt [tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros) 1.2.0+dfsg-11+b1 200.9 kt987.0 kt [tiedostoluettelo]
mips64el 1.2.0+dfsg-11+b1 224.8 kt1,431.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros) 1.2.0+dfsg-11+b1 217.4 kt1,311.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64el 1.2.0+dfsg-11+b1 222.5 kt1,301.0 kt [tiedostoluettelo]
riscv64 1.2.0+dfsg-11+b1 661.5 kt6,408.0 kt [tiedostoluettelo]
s390x 1.2.0+dfsg-11+b1 208.1 kt1,208.0 kt [tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros) 1.2.0+dfsg-11+b1 233.8 kt971.0 kt [tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros) 1.2.0+dfsg-11+b1 186.2 kt1,191.0 kt [tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros) 1.2.0+dfsg-11+b1 214.2 kt1,004.0 kt [tiedostoluettelo]