Paketti: libgkarrays1t64 (2.1.0+dfsg-4.2)

[ Source: libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

Muut pakettiin libgkarrays1t64 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ei armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Imuroi libgkarrays1t64

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	59.5 kt	248.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	56.2 kt	174.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	52.0 kt	245.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	52.5 kt	149.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	51.6 kt	133.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	69.2 kt	193.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	62.7 kt	185.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	70.0 kt	247.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	60.7 kt	181.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	55.0 kt	255.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	59.0 kt	247.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	58.1 kt	246.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	57.7 kt	149.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	52.5 kt	173.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	64.2 kt	246.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	50.0 kt	2,107.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	56.7 kt	169.0 kt	[tiedostoluettelo]