Paketti: kalign (1:3.4.0-1)

[ Source: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Tagit: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Muut pakettiin kalign liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Imuroi kalign

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	85.7 kt	408.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	134.4 kt	1,126.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	83.7 kt	406.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	79.2 kt	304.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	76.9 kt	244.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	83.3 kt	323.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	88.1 kt	340.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	105.1 kt	557.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	80.4 kt	292.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	82.0 kt	420.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	91.3 kt	470.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	99.4 kt	470.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	88.3 kt	286.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	96.2 kt	370.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	88.4 kt	277.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	75.2 kt	2,137.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	91.4 kt	328.0 kt	[tiedostoluettelo]