Paketti: r-bioc-gosemsim (2.28.1-1)

[ Source: r-bioc-gosemsim  ]

GO-terms semantic similarity measures

The semantic comparisons of Gene Ontology (GO) annotations provide quantitative ways to compute similarities between genes and gene groups, and have became important basis for many bioinformatics analysis approaches. GOSemSim is an R package for semantic similarity computation among GO terms, sets of GO terms, gene products and gene clusters. GOSemSim implemented five methods proposed by Resnik, Schlicker, Jiang, Lin and Wang respectively.

Muut pakettiin r-bioc-gosemsim liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [ei alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-api-4.0

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• dep: r-bioc-go.db

  annotation maps describing the entire Gene Ontology

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• dep: r-cran-yulab.utils

  GNU R supporting functions for packages maintained by 'YuLab-SMU'

• sug: r-bioc-annotationhub

  GNU R client to access AnnotationHub resources

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  genome-wide annotation for Human

• sug: r-cran-biocmanager

  access the Bioconductor project package repository

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-rocr

  GNU R package to prepare and display ROC curves

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-tidyr

  GNU R package to easily tidy data

• sug: r-cran-tidyselect

  GNU R select from a set of strings

Imuroi r-bioc-gosemsim

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	873.9 kt	1,091.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	876.1 kt	1,063.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	871.8 kt	1,091.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	871.4 kt	1,042.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	871.4 kt	1,022.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	875.1 kt	1,064.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	877.8 kt	1,061.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	881.1 kt	1,134.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	864.6 kt	1,042.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	871.7 kt	1,096.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	876.6 kt	1,093.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	875.2 kt	1,091.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	874.7 kt	1,042.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	874.5 kt	1,059.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	880.0 kt	1,090.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	869.7 kt	1,991.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	875.9 kt	1,050.0 kt	[tiedostoluettelo]