Paketti: delly (1.1.8-1 ja muut)

[ Source: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Muut pakettiin delly liittyvät paketit

• dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  set of date-time libraries based on generic programming concepts

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [ei x32]

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

  Boost.Iostreams -kirjasto

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [ei x32]

  Boost.Iostreams -kirjasto

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

  program options library for C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [ei x32]

  program options library for C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Operating system (e.g. diagnostics support) library

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  XZ-tiedostomuodon pakkauskirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi delly

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.1.8-1+b3	367.2 kt	1,368.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.1.8-1+b2	394.0 kt	1,200.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.1.8-1+b2	338.2 kt	1,108.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.1.8-1+b2	318.5 kt	1,027.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.1.8-1+b2	329.8 kt	723.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.1.8-1+b2	379.8 kt	1,124.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.1.8-1+b2	419.1 kt	1,251.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.1.8-1+b2	506.4 kt	2,499.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.1.8-1+b2	370.6 kt	1,171.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.1.8-1+b2	354.5 kt	1,474.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.1.8-1+b2	387.6 kt	1,492.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386.6 kt	1,364.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.1.8-1+b2	382.7 kt	884.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.1.8-1+b2	399.0 kt	1,280.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.1.8-1+b2	468.4 kt	1,109.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.1.8-1+b2	323.6 kt	2,077.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.1.8-1+b2	388.2 kt	1,107.0 kt	[tiedostoluettelo]