Tarkennettu haku
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Source: bedtools  ]

Paketti: bedtools (2.27.1+dfsg-4 ja muut)

Links for bedtools

Screenshot

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti bedtools:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Muut pakettiin bedtools liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Imuroi bedtools

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Versio Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros) 2.27.1+dfsg-3 554.2 kt2,274.0 kt [tiedostoluettelo]
amd64 2.27.1+dfsg-4 579.5 kt1,955.0 kt [tiedostoluettelo]
arm64 2.27.1+dfsg-4 515.0 kt1,803.0 kt [tiedostoluettelo]
armel 2.27.1+dfsg-4 468.1 kt1,634.0 kt [tiedostoluettelo]
armhf 2.27.1+dfsg-4 497.1 kt1,190.0 kt [tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros) 2.26.0+dfsg-3 624.5 kt2,371.0 kt [tiedostoluettelo]
hurd-i386 2.26.0+dfsg-5 597.9 kt1,979.0 kt [tiedostoluettelo]
i386 2.27.1+dfsg-4 634.7 kt2,186.0 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-amd64 2.26.0+dfsg-5 569.8 kt1,948.0 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-i386 2.26.0+dfsg-5 616.2 kt2,155.0 kt [tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros) 2.27.1+dfsg-3 562.0 kt1,886.0 kt [tiedostoluettelo]
mips64el 2.27.1+dfsg-4 513.7 kt2,518.0 kt [tiedostoluettelo]
mipsel 2.27.1+dfsg-4 522.3 kt2,394.0 kt [tiedostoluettelo]
powerpcspe (epävirallinen siirros) 2.27.1+dfsg-3 529.0 kt1,959.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros) 2.26.0+dfsg-5 563.4 kt2,404.0 kt [tiedostoluettelo]
ppc64el 2.27.1+dfsg-4 584.6 kt2,407.0 kt [tiedostoluettelo]
riscv64 (epävirallinen siirros) 2.27.1+dfsg-3 571.7 kt1,597.0 kt [tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros) 2.27.1+dfsg-3 678.7 kt1,739.0 kt [tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros) 2.26.0+dfsg-5 460.9 kt1,898.0 kt [tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros) 2.26.0+dfsg-5 555.3 kt1,727.0 kt [tiedostoluettelo]