Paketti: nast-ier (20101212+dfsg1-6) [debports]

[ Source:  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Muut pakettiin nast-ier liittyvät paketit

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6.1 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Imuroi nast-ier

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	20.1 kt	147.0 kt	[tiedostoluettelo]