Paketti: allelecount (4.3.0-2 ja muut)

[ Source: allelecount  ]

NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

Muut pakettiin allelecount liittyvät paketit

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  XZ-tiedostomuodon pakkauskirjasto

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi allelecount

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	4.3.0-2+b1	28.2 kt	119.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	4.3.0-2+b1	28.7 kt	91.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	4.3.0-2+b1	27.8 kt	119.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	4.3.0-2+b1	28.3 kt	86.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	4.3.0-2+b1	27.2 kt	78.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	4.3.0-2+b1	27.8 kt	87.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	4.3.0-2+b1	29.1 kt	90.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	4.3.0-2+b1	32.1 kt	111.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	4.3.0-2+b1	27.1 kt	86.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	4.3.0-2+b1	27.3 kt	121.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	4.3.0-2+b1	29.4 kt	119.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	4.3.0-2+b1	30.0 kt	119.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	4.3.0-2+b2	28.3 kt	83.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	4.3.0-2+b1	28.3 kt	91.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	4.3.0-2+b1	29.2 kt	118.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	4.3.0-2+b1	27.2 kt	1,081.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	4.3.0-2+b1	28.7 kt	90.0 kt	[tiedostoluettelo]