Paketti: gatb-core (1.4.1+git20181225.44d5a44+dfsg-3)

[ Source: gatb-core  ]

Genome Analysis Toolbox with de-Bruijn graph

The GATB-CORE project provides a set of highly efficient algorithms to analyse NGS data sets. These methods enable the analysis of data sets of any size on multi-core desktop computers, including very huge amount of reads data coming from any kind of organisms such as bacteria, plants, animals and even complex samples (e.g. metagenomes). Read more about GATB at https://gatb.inria.fr/. By itself GATB-CORE is not an NGS data analysis tool. However, it can be used to create such tools. There already exist a set of ready-to-use tools relying on GATB-CORE library: see https://gatb.inria.fr/software/

Muut pakettiin gatb-core liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [ei i386]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libhdf5-103

  Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libsz2

  Adaptive Entropy Coding library - SZIP

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi gatb-core

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1,867.1 kt	15,387.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1,761.6 kt	14,923.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1,896.8 kt	14,956.0 kt	[tiedostoluettelo]