Paketti: sniffles (1.0.12b+ds-1)

[ Source: sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Muut pakettiin sniffles liittyvät paketit

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

Imuroi sniffles

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	703.3 kt	1,100.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	681.9 kt	1,040.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	674.2 kt	1,027.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	680.5 kt	899.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	717.0 kt	1,127.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	680.8 kt	1,166.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	682.9 kt	1,147.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	707.2 kt	1,196.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	679.3 kt	1,100.0 kt	[tiedostoluettelo]