Paketti: libgkarrays1 (2.1.0+dfsg-4)

[ Source: libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

Tagit: Role: Shared Library

Muut pakettiin libgkarrays1 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, mipsel]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libgkarrays1

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	55.4 kt	171.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	51.3 kt	154.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	51.7 kt	142.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	50.7 kt	126.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	61.9 kt	178.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	55.0 kt	180.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	60.8 kt	177.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	58.1 kt	243.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	51.9 kt	166.0 kt	[tiedostoluettelo]