Paketti: libssw0 (1.1-13)

[ Source: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Tagit: Role: Shared Library

Muut pakettiin libssw0 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libssw0

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	19.2 kt	55.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	18.1 kt	51.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	20.5 kt	59.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	20.7 kt	51.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	26.5 kt	83.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	26.1 kt	77.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	25.7 kt	72.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	19.4 kt	83.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	23.2 kt	71.0 kt	[tiedostoluettelo]