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Paket: dotur (1.53-2)

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Distanzbasierte OTU und Abschätzung der Artenvielfalt

Das Programm DOTUR verarbeitet eine Distanzmatrix, die die genetische Distanz zwischen DNA-Sequendaten beschreibt, und weist OTUs (operational taxonomic units) Sequenzen zu. Dabei wird entweder der Farthest-, Average- oder Nearest-Neighbor-Algorithmus für alle möglichen Distanzen verwendet, die die Distanzmatrix beschreibt. DOTUR erstellt mit den verknüpften OTU-Daten Collector's- und Rarefaction-Kurven für Beprobungsintensität, Abschätzungen der Artenvielfalt und Diversitätsindizes.

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