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Paket: garlic (1.6-1.1)

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Ein Darstellungsprogramm für Biomoleküle

Garlic wurde zur Untersuchung von Membranproteinen geschrieben. Es kann dazu benutzt werden, andere Proteine sowie einige geometrische Objekte darzustellen. Diese Version von garlic erkennt das PDB-Format in der Version 2.1. Garlic kann auch dazu benutzt werden, Proteinsequenzen zu analysieren.

Es benötigt nur die X-Bibliotheken, keine anderen Bibliotheken werden gebraucht.

Enthaltene Fähigkeiten:

 - Die Position und Dicke der Scheiben sind in einem kleinen Fenster
   sichtbar.
 - Atombindungen und Atome werden als unabhängige, zeichenbare Objekte
   behandelt.
 - Die Farben der Atome und Bindungen hängen von ihrer Position ab. Fünf
   Abbildungsmodi sind verfügbar (wie für die Scheiben).
 - Ist in der Lage, Stereobilder anzuzeigen.
 - Ist in der Lage, andere geometrische Objekte, wie z.B. Membranen,
   anzuzeigen.
 - Atomare Information ist für ein mit dem Mauszeiger bedecktes Atom
   verfügbar. Kein Klick wird benötigt, einfach den Mauszeiger über
   die Struktur bewegen.
 - Ist in der Lage, mehr als eine Struktur zu laden.
 - Ist in der Lage, Ramachandran-Plots, Helixräder, Venn-Diagramme,
   durchschnittliche Hydrophobie und Plots des hydrophoben Moments zu
   zeichnen.
 - Die Eingabeaufforderung ist am unteren Rand des Hauptfensters
   verfügbar. Sie ist in der Lage, eine Fehlermeldung und einen Befehl
   anzuzeigen.

Markierungen: Feld: Biologie, Chemie, Benutzer-Schnittstellen: X-Window-System, Rolle: role::program, scope::utility, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, Zweck: Daten-Visualisierung, X-Window-System: Anwendung

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