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Paket: apbs (1.2.1b-1)

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Anpassungsfähiger Poissen-Boltzmann Problemlöser

APBS ist ein Softwarepaket für die numerische Lösung der Poisson-Boltzmann-Gleichung (PBE: Poisson-Boltzmann equation), eines der bekanntesten Kontinuum-Modelle zur Beschreibung der elektrostatischen Zusammenhänge zwischen Molekularlösungen in Salz und flüssigen Medien.

  * Simulation weit gestreuter Prozesse, um die Bewegung der Ligand-
    Proteine und die Protein-Protein-Verbindungen zu bestimmen,
  * Implizite Lösung der Moleküldynamik der Biophysik,
  * Berechnung von Solvatisierung und Bindungsenergie zur Bestimmung von
    Ligand-Protein- und Protein-Protein-Gleichgewichts-
    Verbindungskonstante und Unterstützung im Medikamentendesign,
  * und Studien biomulekularer Titration.

APBS wurde entwickelt, um effizient elektrostatische Eigenschaften für Simulationen für einen weiten Bereich von Längenskalen zu bewerten, um die Erforschung von Molekülen mit bis zu 10 Mio. Atomen zu ermöglichen.

Markierungen: Feld: Chemie, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug

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