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[ Quellcode: molphy  ]

Paket: molphy (2.3b3-5) [non-free]

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Ähnliche Pakete:

Program Package for MOLecular PHYlogenetics

ProtML is a main program in MOLPHY for inferring evolutionary trees from PROTein (amino acid) sequences by using the Maximum Likelihood method. Other programs (C language)

 NucML:  Maximum Likelihood Inference of Nucleic Acid Phylogeny
 ProtST: Basic Statistics of Protein Sequences
 NucST:  Basic Statistics of Nucleic Acid Sequences
 NJdist: Neighbor Joining Phylogeny from Distance Matrix
Utilities (Perl)
 mollist:  get identifiers list        molrev:   reverse DNA sequences
 molcat:   concatenate sequences       molcut:   get partial sequences
 molmerge: merge sequences             nuc2ptn:  DNA -> Amino acid
 rminsdel: remove INS/DEL sites        molcodon: get specified codon sites
 molinfo:  get varied sites            mol2mol:  MOLPHY format beautifer
 inl2mol:  Interleaved -> MOLPHY       mol2inl:  MOLPHY -> Interleaved
 mol2phy:  MOLPHY -> Sequential        phy2mol:  Sequential -> MOLPHY
 must2mol: MUST -> MOLPHY              etc.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Analyse, Vergleichen

Andere Pakete mit Bezug zu molphy

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ia64 410,4 kB1.432,0 kB [Liste der Dateien]
mips 310,4 kB1.024,0 kB [Liste der Dateien]
mipsel 311,2 kB984,0 kB [Liste der Dateien]
powerpc 299,7 kB908,0 kB [Liste der Dateien]
s390 268,2 kB856,0 kB [Liste der Dateien]
sparc 268,5 kB840,0 kB [Liste der Dateien]