Paket: velvet-long (1.2.10+dfsg1-8 und andere)

Links für velvet-long

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Quellcode-Paket velvet herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads, long version

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

This package installs special long-mode versions of Velvet, as recommended in the Velvet tutorials.

Andere Pakete mit Bezug zu velvet-long

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: velvet

Assembler für Sequenzen von Nukleinsäuren von sehr kleinen Bruchstücken (»short reads«)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

velvet-long herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.2.10+dfsg1-8	242,1 kB	2.955,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.2.10+dfsg1-8	205,8 kB	1.832,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.2.10+dfsg1-8	186,7 kB	1.990,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.2.10+dfsg1-8	216,1 kB	2.309,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.2.10+dfsg1-8	193,0 kB	1.350,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.2.10+dfsg1-8	258,2 kB	2.386,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.2.10+dfsg1-8	237,8 kB	2.344,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.2.10+dfsg1-8	328,5 kB	5.411,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.2.10+dfsg1-8	180,8 kB	1.700,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.2.10+dfsg1-8	193,8 kB	2.440,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.2.10+dfsg1-8	203,8 kB	2.650,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.2.10+dfsg1-8	213,6 kB	2.635,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.2.10+dfsg1-8+b1	271,4 kB	2.044,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.2.10+dfsg1-8	192,1 kB	1.942,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.2.10+dfsg1-8	222,4 kB	2.300,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.2.10+dfsg1-8	210,2 kB	10.340,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.2.10+dfsg1-8	199,5 kB	1.790,0 kB	[Liste der Dateien]