Paket: sumaclust (1.0.36+ds-2 und andere)

Links für sumaclust

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket sumaclust herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Tim Booth (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)
Pierre Gruet (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [metabarcoding.org]

fast and exact clustering of genomic sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.

Andere Pakete mit Bezug zu sumaclust

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [nicht alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgomp1 (>= 6)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust

sumaclust herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.0.36+ds-2	101,8 kB	196,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.0.36+ds-2	100,6 kB	164,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.0.36+ds-2	99,6 kB	195,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.0.36+ds-2	101,6 kB	195,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.0.36+ds-2	99,5 kB	195,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.0.36+ds-2	100,9 kB	160,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.0.36+ds-2	100,9 kB	163,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.0.36+ds-2	104,5 kB	181,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.0.36+ds-2	98,8 kB	163,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.0.36+ds-2	100,1 kB	197,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.0.36+ds-2	101,5 kB	196,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.0.36+ds-2	101,4 kB	260,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.0.36+ds-2+b1	100,4 kB	156,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.0.36+ds-2	99,5 kB	159,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.0.36+ds-2	100,3 kB	195,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.0.36+ds-2	99,5 kB	1.157,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.0.36+ds-2	100,6 kB	163,0 kB	[Liste der Dateien]