Paket: seqan-raptor (3.0.1+ds-5 und andere)

[ Quellcode: seqan-raptor  ]

pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences

Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.

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• sug: cwl-runner

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch cwltool, toil

seqan-raptor herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	3.0.1+ds-5	579,4 kB	2.362,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	3.0.1+ds-5	646,1 kB	2.087,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	3.0.1+ds-5	551,8 kB	1.911,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3	695,6 kB	4.733,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	3.0.1+ds-5	529,1 kB	2.319,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	3.0.0+ds-2	458,7 kB	1.831,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	3.0.1+ds-5	633,6 kB	2.359,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	3.0.1+ds-5+b1	620,9 kB	1.560,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	3.0.1+ds-2	473,3 kB	2.111,0 kB	[Liste der Dateien]