Paket: sprai (0.9.9.23+dfsg1-2 und andere)

[ Quellcode: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Andere Pakete mit Bezug zu sprai

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nicht alpha, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• dep: time

  GNU-Programm »time« zur Messung des CPU-Ressourcenverbrauchs

• sug: make

  Werkzeug zur Steuerung der Kompilierung

• sug: pbalign

  Paket nicht verfügbar

• sug: pbgenomicconsensus

  Paket nicht verfügbar

• sug: pbh5tools

  Paket nicht verfügbar

sprai herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.9.9.23+dfsg1-2	1.477,6 kB	1.714,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.9.9.23+dfsg1-2	1.475,9 kB	1.706,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.9.9.23+dfsg1-2	1.473,9 kB	1.694,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.9.9.23+dfsg1-2	1.473,3 kB	1.686,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.9.9.23+dfsg1-2	1.471,6 kB	1.666,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.9.9.23+dfsg1-2	1.475,2 kB	1.694,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.9.9.23+dfsg1-2	1.477,0 kB	1.710,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.9.9.23+dfsg1-2	1.485,0 kB	1.738,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.9.9.23+dfsg1-2	1.470,4 kB	1.686,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.9.9.23+dfsg1-2	1.476,7 kB	1.705,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.9.9.23+dfsg1-2	1.477,3 kB	1.882,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.9.9.23+dfsg1-2	1.477,6 kB	1.882,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.9.9.23+dfsg1-2+b1	1.474,3 kB	1.690,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.9.9.23+dfsg1-2	1.473,9 kB	1.698,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.9.9.23+dfsg1-2	1.475,1 kB	1.678,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.9.9.23+dfsg1-2	1.473,7 kB	1.717,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.9.9.23+dfsg1-2	1.474,9 kB	1.702,0 kB	[Liste der Dateien]