Paket: spoa (4.1.4-1)

[ Quellcode: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere Pakete mit Bezug zu spoa

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

spoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	35,9 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	37,2 kB	82,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	36,0 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	34,7 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	34,0 kB	61,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	37,7 kB	82,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	37,8 kB	77,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	41,3 kB	106,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	35,9 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	36,3 kB	100,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	37,1 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	37,7 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	35,9 kB	70,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	37,1 kB	78,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	38,5 kB	97,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	34,8 kB	1.060,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	37,0 kB	77,0 kB	[Liste der Dateien]