Paket: sibsim4 (0.20-5 und andere)

[ Quellcode: sibsim4  ]

Richtet exprimierte RNA-Sequenzen an einer DNA-Vorlage aus

Das SIBsim4-Projekt basiert auf sim4, einem Programm, das entwickelt wurde, um eine exprimierte DNA-Sequenz mit einer genomischen Sequenz abzustimmen um Intronen zu erlauben. SIBsim4 ist eine recht umfangreiche Neuerstellung des ursprünglichen Codes mit den folgenden Zielen:

 * Geschwindigkeitsverbesserung;
 * Einsetzbarkeit auf großen (Größenordnung von Chromosomen)
   DNA-Sequenzen;
 * detailliertere Ausgabe über Spleiß-Typen;
 * detailliertere Ausgabe über Poly(A)-Schwänze;
 * verschiedene Aufräumarbeiten und Verbesserungen des Codes.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::TODO, use::comparing, Suchen, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

sibsim4 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.20-5	30,9 kB	85,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.20-5	29,7 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.20-5	28,1 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.20-5	27,5 kB	72,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.20-5	26,2 kB	56,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.20-5	28,8 kB	69,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.20-5	30,8 kB	80,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.20-5	36,3 kB	112,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.20-5	25,6 kB	60,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.20-5	29,3 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.20-5	31,9 kB	150,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.20-5	31,9 kB	85,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.20-5+b1	30,7 kB	65,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.20-5	30,5 kB	77,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.20-5	29,5 kB	60,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.20-5	27,7 kB	78,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.20-5	28,5 kB	72,0 kB	[Liste der Dateien]