Paket: pbbamtools (2.4.0+dfsg-1 und andere)

[ Quellcode: pbbam  ]

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Andere Pakete mit Bezug zu pbbamtools

• dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, m68k, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht ia64, m68k, sh4]

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  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhts3 (>= 1.10) [m68k, sh4]

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libhts3t64 (>= 1.17) [nicht m68k, sh4]

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libpbbam1.3.0 (= 1.3.0+dfsg-2) [m68k, sh4]

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b3) [nicht m68k, sh4]

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

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  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [nicht m68k, sh4]

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

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  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• rec: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.4.0+dfsg-1+b3	120,9 kB	686,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.4.0+dfsg-1+b3	129,6 kB	475,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.4.0+dfsg-1+b3	115,8 kB	619,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.4.0+dfsg-1+b3	145,0 kB	712,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.3.0+dfsg-2	79,1 kB	274,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.4.0+dfsg-1+b3	120,5 kB	703,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.4.0+dfsg-1+b3	126,8 kB	683,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.4.0+dfsg-1+b3	122,4 kB	363,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.3.0+dfsg-2	88,0 kB	256,0 kB	[Liste der Dateien]