Paket: infernal (1.1.5-2 und andere)

[ Quellcode: infernal  ]

Rückschluss auf Alignments der RNA-Sekundärstruktur

Infernal ("INFERence of RNA ALignment") durchsucht DNA-Sequenzdatenbanken nach RNA-Struktur- und Sequenzähnlichkeiten. Es stellt eine Implementierung eines Spezialfalls der stochastisch kontextfreien Grammatiken, den sogenannten Kovarianzmodellen (CMs), bereit. Ein CM ist wie ein Sequenzprofil, bewertet jedoch eine Kombination aus Sequenzübereinstimmung und Übereinstimmung sekundärer RNA-Strukturen. Daher kann ein CM in vielen Fällen eher RNA- Homologe erkennen, deren Sekundärstruktur besser konserviert ist als deren primäre Sequenz.

Dieses Werkzeug ist eine integrale Komponente der Datenbank Rfam.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu infernal

• dep: libc6 (>= 2.10) [hppa]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.13) [ppc64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.3) [m68k, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, i386, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.0.2-2	5.014,4 kB	10.940,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.1.5-2	5.775,3 kB	51.445,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.1.5-2	5.404,2 kB	49.554,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.0.2-1	4.144,2 kB	8.324,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.1.5-2	5.791,7 kB	56.163,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.0.2-2	3.371,3 kB	7.800,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.0.2-2	4.909,3 kB	11.058,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.0.2-2	4.311,1 kB	7.876,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.0.2-2	4.465,1 kB	9.210,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.1.5-2	5.774,0 kB	50.402,0 kB	[Liste der Dateien]