Paket: bppsuite (2.4.1-7)

[ Quellcode: bppsuite  ]

Bio++ program suite

The Bio++ Program Suite is a package of programs using the Bio++ libraries and dedicated to Phylogenetics and Molecular Evolution. All programs are independent, but can be combined to perform rather complex analyses. These programs use the interface helper tools of the libraries, and hence share the same syntax. They also have several options in common, which may also be shared by third-party software.

The following programs are included:

 - BppML for maximum likelihood analysis,
 - BppSeqGen for sequences simulation,
 - BppAncestor for ancestral states reconstruction,
 - BppDist for distance methods,
 - BppPars for parsimony analysis,
 - BppSeqMan for file conversion and sequence manipulation,
 - BppConsense for building consensus tree and computing
   bootstrap values,
 - BppReRoot for tree rerooting.
 - BppTreeDraw for tree drawing.
 - BppAlnScore for comparing alignments and computing alignment scores.
 - BppMixedLikelihoods for computing site per site likelihoods of
   components of mixture models.
 - BppPopGen for population genetics analyses.

Andere Pakete mit Bezug zu bppsuite

• dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Core library

• dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Phylogenetic library

• dep: libbpp-popgen8t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Population Genetics library

• dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Sequence library

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht alpha]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• sug: bppsuite-examples

  Examples for Bio++ program suite

bppsuite herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	372,9 kB	2.439,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	379,9 kB	2.002,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	354,2 kB	2.422,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	321,6 kB	1.606,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	328,6 kB	1.326,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	391,4 kB	2.024,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	386,4 kB	1.830,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	386,9 kB	2.965,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	367,7 kB	1.794,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	346,9 kB	2.606,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	380,2 kB	2.806,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	376,2 kB	2.614,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	363,1 kB	1.670,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	359,2 kB	1.994,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	402,9 kB	2.166,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	332,2 kB	12.453,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	377,5 kB	1.742,0 kB	[Liste der Dateien]