Paket: fastani (1.33-3) [debports]

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Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity

ANI is defined as mean nucleotide identity of orthologous gene pairs shared between two microbial genomes. FastANI supports pairwise comparison of both complete and draft genome assemblies.

Andere Pakete mit Bezug zu fastani

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• rec: r-cran-genoplotr

  Plot Publication-Grade Gene and Genome Maps

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
m68k (inoffizielle Portierung)	97,7 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]