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Paket: ltrsift (1.0.2-7)

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Nachbearbeitung und Klassifikation von LTR-Retrotransposonen

LTRsift ist ein grafisches Werkzeug für die halbautomatische Nachbearbeitung von de-novo vorhergesagten Annotationen von LTR-Retrotransposonen, etwa bei den von LTRharvest und LTRdigest erstellten. Die benutzerfreundliche Oberfläche zeigt LTR-Retrotransposon-Kandidaten, deren mutmaßliche Familien und deren interne Struktur auf hierarchische Art an. Dadurch wird es dem Benutzer ermöglicht die teilweise großen Resultate der de-novo-Vorhersage-Software zu »durchsieben« (sift). Funktionen für anpassbares Filtern und Klassifizieren sind ebenso verfügbar.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::graphical, Benutzer-Schnittstellen: X-Window-System, Rolle: Programm, Zweck: scope::utility, uitoolkit::gtk, Zweck: Analyse, Browsen, use::comparing, use::organizing, Daten-Visualisierung, X-Window-System: Anwendung

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