Paket: libhts-dev (1.19+ds-1.1 und andere)
Links für libhts-dev
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket htslib herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Michael R. Crusoe (QS-Seite)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate - Entwicklungsdateien
HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.
HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.
Dieses Paket enthält Entwicklungsdateien für die HTSlib: Header, statische Bibliothek, Handbuchseiten, etc.
Aus Gründen der Kompatibilität mit sambamba wurde die interne Routine cram_to_bam exportiert, wobei ein in guix gefundener Patch übernommen wurde.
Andere Pakete mit Bezug zu libhts-dev
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- Kompressionsbibliothek - Entwicklung
libhts-dev herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.641,3 kB | 7.400,0 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.627,5 kB | 6.862,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.566,2 kB | 6.657,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.557,4 kB | 4.938,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.560,3 kB | 4.675,0 kB | [Liste der Dateien] |
| hppa (inoffizielle Portierung) | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.702,4 kB | 5.374,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.621,0 kB | 4.932,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 (inoffizielle Portierung) | 1.19+ds-1.1+b1 | 2.024,1 kB | 8.348,0 kB | [Liste der Dateien] |
| m68k (inoffizielle Portierung) | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.439,3 kB | 5.045,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.656,8 kB | 7.295,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64 (inoffizielle Portierung) | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.621,4 kB | 7.028,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.670,1 kB | 7.071,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 1.19+ds-1.1+b1 | 2.958,3 kB | 29.794,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.602,7 kB | 6.790,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sh4 (inoffizielle Portierung) | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.597,3 kB | 4.813,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sparc64 (inoffizielle Portierung) | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.496,1 kB | 6.755,0 kB | [Liste der Dateien] |
| x32 (inoffizielle Portierung) | 1.19+ds-1.1+b1 | 1.603,4 kB | 5.399,0 kB | [Liste der Dateien] |