Paket: libedlib-dev (1.2.7-7 und andere)

[ Quellcode: libedlib  ]

library for sequence alignment using edit distance (devel)

A lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance.

Calculating edit distance of two strings is as simple as:

 edlibAlign("hello", 5, "world!", 6,
            edlibDefaultAlignConfig()).editDistance;

Features

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

This package contains the static library and the header files.

Markierungen: Software-Entwicklung: Bibliotheken, Rolle: Entwicklungs-Bibliothek

Andere Pakete mit Bezug zu libedlib-dev

• dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

  library for sequence alignment using edit distance

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-7+b1) [nicht ia64, x32]

libedlib-dev herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.2.7-7+b1	22,3 kB	84,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.2.7-7+b1	23,5 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.2.7-7+b1	24,5 kB	84,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.2.7-7+b1	20,0 kB	59,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.2.7-7+b1	22,3 kB	67,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.2.7-7+b1	22,4 kB	69,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.2.7-5	24,5 kB	91,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64	1.2.7-7+b1	49,4 kB	413,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.2.7-7+b1	21,4 kB	67,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.2.7-7+b1	22,9 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.2.7-7+b1	25,5 kB	84,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.2.7-7+b1	45,9 kB	374,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.2.7-7+b1	24,0 kB	77,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.2.7-7+b1	23,2 kB	64,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.2.7-7+b1	20,0 kB	67,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.2.7-5+b1	22,2 kB	70,0 kB	[Liste der Dateien]