Paket: hyphy-mpi (2.5.60+dfsg-1)

[ Quellcode: hyphy  ]

Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (MPI-Version)

HyPhy ist ein quelloffenes Softwarepaket für die Analyse genetischer Sequenzen unter Verwendung phylogenetischer Techniken, molekularer Evolution und maschinellem Lernen. Es beinhaltet eine komplette grafische Benutzeroberfläche (GUI) und eine mächtige Skriptsprache für grenzenlose Anpassungsmöglichkeiten der Analysen. Zusätzlich unterstützt HyPhy Umgebungen für parallele Datenverarbeitung (via einer Schnittstelle für den Nachrichtenaustausch) und kann als Laufzeitbibliothek kompiliert und von anderen Programmierumgebungen, wie Python oder R, aufgerufen werden. Die Weiterentwicklung von HyPhy wird momentan teilweise von einem Forschungsprojekt-Zuschuss der NIGMS (1R01GM093939) unterstützt.

Dieses Paket enthält eine ausführbare Datei, die MPI für Simultanverarbeitung verwendet.

Andere Pakete mit Bezug zu hyphy-mpi

• dep: hyphy-common (= 2.5.60+dfsg-1)

  Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (gemeinsame Dateien)

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2) [alpha, ia64, x32]

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [nicht alpha, ia64, x32]

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Laufzeit-Bibliothek für SQLite 3

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

hyphy-mpi herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	838,6 kB	2.917,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.497,1 kB	7.514,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	797,8 kB	2.336,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	771,7 kB	2.167,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	760,2 kB	1.487,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	813,0 kB	2.394,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.017,2 kB	2.667,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.061,2 kB	4.867,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	767,6 kB	2.399,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	788,6 kB	3.490,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	895,8 kB	3.040,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	916,0 kB	2.848,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	890,2 kB	1.864,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	952,8 kB	2.680,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	924,5 kB	2.080,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	714,2 kB	3.114,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	929,3 kB	2.335,0 kB	[Liste der Dateien]