Paket: flye (2.9.3+dfsg2-1)
Links für flye
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket flye herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs
Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.
Andere Pakete mit Bezug zu flye
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- dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht alpha, ia64, riscv64]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
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- dep: minimap2
- versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: python3-six
- Python 2 and 3 compatibility library
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- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
flye herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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alpha (inoffizielle Portierung) | 22.589,8 kB | 37.051,0 kB | [Liste der Dateien] |
amd64 | 22.636,3 kB | 36.913,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 22.561,7 kB | 36.792,0 kB | [Liste der Dateien] |
ia64 (inoffizielle Portierung) | 22.763,6 kB | 38.428,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 22.557,3 kB | 37.103,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64 (inoffizielle Portierung) | 22.630,0 kB | 37.241,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 22.638,2 kB | 37.176,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 22.615,6 kB | 36.508,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 22.668,3 kB | 37.096,0 kB | [Liste der Dateien] |