[ Quellcode: libedlib ]
Paket: edlib-aligner (1.2.7-5)
Links für edlib-aligner
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket libedlib herunterladen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
edlib sequence alignment tool using edit distance
Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.
Features of libedlib
* Calculates edit distance (Levehnstein distance). * It can find optimal alignment path (instructions how to transform first sequence into the second sequence). * It can find just the start and/or end locations of alignment path - can be useful when speed is more important than having exact alignment path. * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and infix(HW), each of them useful for different scenarios. * You can extend character equality definition, enabling you to e.g. have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to work with degenerate nucleotides. * It can easily handle small or very large sequences, even when finding alignment path, while consuming very little memory. * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.
Andere Pakete mit Bezug zu edlib-aligner
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- dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libedlib1 (= 1.2.7-5)
- library for sequence alignment using edit distance
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC Support-Bibliothek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC Support-Bibliothek
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
edlib-aligner herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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alpha (inoffizielle Portierung) | 22,1 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
amd64 | 24,1 kB | 66,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 22,4 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 19,8 kB | 53,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 19,9 kB | 49,0 kB | [Liste der Dateien] |
hppa (inoffizielle Portierung) | 22,6 kB | 58,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 23,1 kB | 65,0 kB | [Liste der Dateien] |
ia64 (inoffizielle Portierung) | 27,5 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
m68k (inoffizielle Portierung) | 22,7 kB | 61,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 22,9 kB | 87,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64 (inoffizielle Portierung) | 24,9 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 27,5 kB | 86,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 22,4 kB | 54,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 26,5 kB | 74,0 kB | [Liste der Dateien] |
sh4 (inoffizielle Portierung) | 24,5 kB | 85,0 kB | [Liste der Dateien] |
sparc64 (inoffizielle Portierung) | 20,5 kB | 1.047,0 kB | [Liste der Dateien] |
x32 (inoffizielle Portierung) | 24,1 kB | 65,0 kB | [Liste der Dateien] |