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Paket: blixem (4.44.1+dfsg-3)

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Ähnliche Pakete:

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Markierungen: GUI-Baukasten: GTK

Andere Pakete mit Bezug zu blixem

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armel 286,6 kB943,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 292,9 kB739,0 kB [Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung) 333,5 kB1.149,0 kB [Liste der Dateien]
i386 362,8 kB1.285,0 kB [Liste der Dateien]
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mipsel 347,3 kB1.464,0 kB [Liste der Dateien]
powerpcspe (inoffizielle Portierung) 320,8 kB1.281,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung) 346,0 kB1.667,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 348,6 kB1.539,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 (inoffizielle Portierung) 326,4 kB951,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 311,8 kB1.211,0 kB [Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung) 361,5 kB1.129,0 kB [Liste der Dateien]
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x32 (inoffizielle Portierung) 342,6 kB1.105,0 kB [Liste der Dateien]