Alle Optionen
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Quellcode: bedtools  ]

Paket: bedtools (2.27.1+dfsg-4 und andere)

Links für bedtools

Screenshot

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket bedtools herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Suite, Zweck: use::analysing, use::comparing, Daten-Konvertierung, use::filtering, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu bedtools

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • erweitert

bedtools herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha (inoffizielle Portierung) 2.27.1+dfsg-3 554,2 kB2.274,0 kB [Liste der Dateien]
amd64 2.27.1+dfsg-4 579,5 kB1.955,0 kB [Liste der Dateien]
arm64 2.27.1+dfsg-4 515,0 kB1.803,0 kB [Liste der Dateien]
armel 2.27.1+dfsg-4 468,1 kB1.634,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 2.27.1+dfsg-4 497,1 kB1.190,0 kB [Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung) 2.26.0+dfsg-3 624,5 kB2.371,0 kB [Liste der Dateien]
hurd-i386 2.26.0+dfsg-5 597,9 kB1.979,0 kB [Liste der Dateien]
i386 2.27.1+dfsg-4 634,7 kB2.186,0 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-amd64 2.26.0+dfsg-5 569,8 kB1.948,0 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-i386 2.26.0+dfsg-5 616,2 kB2.155,0 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 2.27.1+dfsg-3 562,0 kB1.886,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 2.27.1+dfsg-4 513,7 kB2.518,0 kB [Liste der Dateien]
mipsel 2.27.1+dfsg-4 522,3 kB2.394,0 kB [Liste der Dateien]
powerpcspe (inoffizielle Portierung) 2.27.1+dfsg-3 529,0 kB1.959,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung) 2.26.0+dfsg-5 563,4 kB2.404,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 2.27.1+dfsg-4 584,6 kB2.407,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 (inoffizielle Portierung) 2.27.1+dfsg-3 571,7 kB1.597,0 kB [Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung) 2.27.1+dfsg-3 678,7 kB1.739,0 kB [Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung) 2.26.0+dfsg-5 460,9 kB1.898,0 kB [Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung) 2.26.0+dfsg-5 555,3 kB1.727,0 kB [Liste der Dateien]