Paket: libpicard-java (3.4.0+dfsg-1)

Links für libpicard-java

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket picard-tools herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Charles Plessy (QS-Seite)
Olivier Sallou (QS-Seite)
Vincent Danjean (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)
Steffen Moeller (QS-Seite)
Pierre Gruet (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [broadinstitute.github.io]

Java-Bibliothek zur Bearbeitung von SAM- und BAM-Dateien

Das generische Format SAM (Sequence Alignment/Map) speichert große Nukleotid-Sequenzalignments. Diese Bibliothek enthält Klassen zum Bearbeiten von SAM- und BAM-Dateien.

Ein Befehlszeilen-Wrapper für diese Bibliothek wird im Paket picard-tools bereitgestellt.

Andere Pakete mit Bezug zu libpicard-java

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbarclay-java

Java library to parse command line
dep: libcommons-collections4-java

Apache Commons Collections - Extended Collections API for Java
dep: libcommons-io-java

Häufig genutzte, nützliche E/A-Klassen
dep: libcommons-lang-java

Commons Lang - Erweiterung des Pakets java.lang
dep: libcommons-lang3-java

Apache Commons Lang - Hilfsklassen
dep: libcommons-math3-java

Java lightweight mathematics and statistics components
dep: libgkl-java

Java library to manipulate SAM and BAM files
dep: libguava-java

Suite of Google common libraries for Java
dep: libhtsjdk-java

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
dep: libjoptsimple-java

Command line parsing java library

rec: r-base-core

GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

sug: picard-tools

Command line tools to manipulate SAM and BAM files

libpicard-java herunterladen

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