Alle Optionen
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Quellcode: anfo  ]

Paket: anfo (0.98-4 und andere)

Links für anfo

Screenshot

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket anfo herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

Alignments/Abbildungen kurzer DNA-Sequenzen, von MPG

Anfo ist ein Mapper in der Art von Soap/Maq/Bowtie, aber die Implementierung ähnelt eher BLAST/BLAT. Anful ist für Alignments sequenzierter Reads (kurze DNA-Sequenzen) am nützlichsten, wenn die DNA-Sequenz irgendwie verändert wurde (etwa sehr alte DNA oder Bisulfit-Behandlung) und/oder wenn es zwischen Probe und Referenz mehr Abweichungen gibt, als schnelle Mapper problemlos vertragen (etwa wenn das Referenzgenom fehlt und stattdessen eine verwandte Spezies benutzt wird).

Andere Pakete mit Bezug zu anfo

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • erweitert

anfo herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
armhf 0.98-4+b1 104,4 kB328,0 kB [Liste der Dateien]