Paket: ssw-align (1.2.5-1) [debports]

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Experimentelles Paket

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Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Andere Pakete mit Bezug zu ssw-align

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libssw1 (= 1.2.5-1)

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64 (inoffizielle Portierung)	23,3 kB	84,0 kB	[Liste der Dateien]