Paket: stacks-web (2.2+dfsg-1)

[ Quellcode: stacks  ]

web interface for displaying loci from short-read sequences

Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.

This package provides the web-based viewer which you can use to examine Stacks output that has been loaded into a MySQL database.

Andere Pakete mit Bezug zu stacks-web

• dep: apache2

  HTTP-Server Apache

  oder httpd

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch apache2, ebhttpd, lighttpd, micro-httpd, mini-httpd, nginx-extras, nginx-full, nginx-light, tntnet, webfs, yaws

• dep: default-mysql-server

  Datenbank MySQL - Serverprogramme und Einrichtung von Systemdatenbanken (Metapaket)

  oder virtual-mysql-server

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch mariadb-server-10.3

• dep: libapache2-mod-php

  Serverseitige, in HTML eingebettete Skriptsprache (Standardmodul für Apache 2)
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libapache2-mod-php7.3

  oder php-cgi

  Serverseitige, in HTML eingebettete Skriptsprache (CGI-Programm) (Standard)
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch php7.3-cgi

• dep: libdbd-mysql-perl

  Perl5-Datenbankschnittstelle zur Datenbank MariaDB/MySQL

• dep: php-mdb2-driver-mysql

  MDB2-Treiber für MySQL

• rec: stacks

  pipeline for building loci from short-read DNA sequences

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