Paket: murasaki-mpi (1.68.6-8 und andere)
Links für murasaki-mpi
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket murasaki herunterladen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
Ähnliche Pakete:
homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.
Andere Pakete mit Bezug zu murasaki-mpi
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- dep: murasaki-common
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)
murasaki-mpi herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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amd64 | 1.68.6-8+b1 | 614,8 kB | 4.026,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 1.68.6-8+b1 | 548,8 kB | 3.862,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 1.68.6-8+b1 | 409,1 kB | 2.680,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 1.68.6-8+b1 | 417,4 kB | 2.024,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 1.68.6-8+b1 | 625,1 kB | 3.900,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips | 1.68.6-8+b1 | 562,1 kB | 4.503,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 1.68.6-8+b1 | 594,4 kB | 5.157,0 kB | [Liste der Dateien] |
mipsel | 1.68.6-8+b1 | 581,4 kB | 4.503,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 1.68.6-8+b1 | 618,2 kB | 5.074,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 1.68.6-8+b1 | 548,8 kB | 4.358,0 kB | [Liste der Dateien] |