Paket: libhtsjdk-java (2.18.2+dfsg-2)

Links für libhtsjdk-java

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket htsjdk herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Charles Plessy (QS-Seite)
Olivier Sallou (QS-Seite)
Vincent Danjean (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [samtools.github.io]

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

HTSJDK is an implementation of a unified Java library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map) and VCF, used for high-throughput sequencing data. There are also an number of useful utilities for manipulating HTS data.

Andere Pakete mit Bezug zu libhtsjdk-java

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libcommons-compress-java

Java-API zum Arbeiten mit Komprimierungs- und Archivformaten
dep: libcommons-jexl2-java

Apache Commons JEXL - Java Expression Language
dep: libcommons-logging-java

Gemeinsame Wrapper-Schnittstelle für verschiedene Protokollierungs-APIs
dep: libjaxb-java

JAXB Reference Implementation
dep: libngs-java

Next Generation Sequencing language Bindings (Java bindings)
dep: libsnappy-java

Snappy für Java, ein schnelles Komprimierungs-/Dekomprimierungsprogramm
dep: libxz-java

Java library with a complete implementation of XZ data compression

sug: picard-tools

Kommandozeilenwerkzeuge zur Bearbeitung von SAM- und BAM-Dateien
sug: python3

Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)

libhtsjdk-java herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
all	1.464,1 kB	1.641,0 kB	[Liste der Dateien]