Paket: vsearch (2.10.4-1)

Links für vsearch

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket vsearch herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Tim Booth (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

tool for processing metagenomic sequences

Versatile 64-bit multithreaded tool for processing metagenomic sequences, including searching, clustering, chimera detection, dereplication, sorting, masking and shuffling

The aim of this project is to create an alternative to the USEARCH tool developed by Robert C. Edgar (2010). The new tool should:

 - have a 64-bit design that handles very large databases and much more
   than 4GB of memory
 - be as accurate or more accurate than usearch
 - be as fast or faster than usearch

Andere Pakete mit Bezug zu vsearch

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

vsearch herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	312,1 kB	540,0 kB	[Liste der Dateien]