Paket: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3 und andere)

[ Quellcode: tvc  ]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Andere Pakete mit Bezug zu tvc

• dep: libarmadillo10 (>= 1:10.1.2+dfsg)

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libjsoncpp24 (>= 1.9.4)

  C++-Bibliothek zum Lesen und Schreiben von JavaScript Object Notation

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nicht armel, armhf]

• dep: python3

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	1.050,4 kB	3.406,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	979,3 kB	3.194,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	940,0 kB	3.090,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	958,2 kB	2.658,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	1.082,4 kB	3.453,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	994,0 kB	3.670,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	993,5 kB	3.575,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	1.056,5 kB	3.734,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-3+b2	978,2 kB	3.425,0 kB	[Liste der Dateien]